Ben-To menceritakan tentang You Satou, seorang siswa SMA yang secara tak sengaja terlibat dalam pertarungan sengit antar pelajar di sebuah minimarket. Pertarungan tersebut bukan tanpa alasan—mereka semua saling bersaing untuk mendapatkan bento diskon (makanan siap saji yang dijual setengah harga). Dalam dunia ini, para pemburu bento yang tangguh disebut “Serigala”, dan ada aturan tidak tertulis serta kode etik yang harus dipatuhi.
Setelah beberapa kali mengalami kekalahan, Satou kemudian direkrut oleh seorang gadis kuat bernama Sen Yarizui, pemimpin Klub Makan Setengah Harga. Bersama rekan-rekannya, Satou mulai belajar cara bertarung, etika berburu bento, dan menjalani kehidupan sekolah yang tak biasa, penuh persaingan di luar jam pelajaran.