Oniichan no Koto nanka Zenzen Suki ja Nai n da kara ne!! mengikuti kisah Nao Takanashi, seorang gadis yang memiliki perasaan cinta yang terlarang terhadap kakak laki-lakinya, Shuusuke. Meskipun Nao mencoba menutupi perasaannya dengan bersikap dingin dan menyebalkan terhadap Shuusuke, dia sebenarnya sangat mencintainya dan sering kali merencanakan berbagai cara untuk mendekatinya.
Namun, situasi menjadi semakin rumit ketika Shuusuke mulai menerima perhatian dari gadis-gadis lain, yang membuat Nao merasa cemburu. Untuk membuatnya lebih sulit, terungkap bahwa Shuusuke mungkin bukan kakak kandungnya yang sebenarnya, yang semakin memperkeruh konflik emosional yang mereka alami.
